242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0404 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 468 aa  948    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  42.83 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  67.52 
 
 		 749 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  44.04 
 
 		 1234 aa  317  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  53.97 
 
 		 581 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  49.03 
 
 		 627 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  51.34 
 
 		 735 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  47.06 
 
 		 828 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  48.93 
 
 		 919 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  46.37 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  47.95 
 
 		 329 aa  202  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  41.63 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  52.29 
 
 		 1035 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.85 
 
 		 366 aa  146  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  45.69 
 
 		 954 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 875 aa  143  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  36.18 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  50.32 
 
 		 1799 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  39.51 
 
 		 930 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  44.07 
 
 		 1262 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.01 
 
 		 802 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  37.75 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  48.67 
 
 		 1356 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  47.92 
 
 		 1380 aa  123  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  46.98 
 
 		 819 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 		 845 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.11 
 
 		 719 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  46.31 
 
 		 870 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  46 
 
 		 840 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  42.42 
 
 		 777 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  34.98 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  46.58 
 
 		 823 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 3295 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 		 2554 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  43.06 
 
 		 1732 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.95 
 
 		 786 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  49.54 
 
 		 958 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  54.05 
 
 		 479 aa  113  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  41.46 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  46 
 
 		 1387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  50 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  35.83 
 
 		 698 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  62.34 
 
 		 697 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  40.98 
 
 		 966 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  67.14 
 
 		 787 aa  106  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  35.81 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  45.54 
 
 		 848 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  35.64 
 
 		 801 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  63.38 
 
 		 676 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  41.91 
 
 		 831 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  31.48 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.91 
 
 		 933 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  58.23 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  56.1 
 
 		 930 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  44.3 
 
 		 627 aa  99.8  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  39.49 
 
 		 579 aa  100  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  42.76 
 
 		 739 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  63.64 
 
 		 403 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  56.96 
 
 		 709 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  32.21 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  38.89 
 
 		 630 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  54.43 
 
 		 668 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  41.18 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.42 
 
 		 869 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.53 
 
 		 1707 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  39.61 
 
 		 918 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  42.59 
 
 		 522 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  60.56 
 
 		 1056 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  56.58 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  36.9 
 
 		 1338 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 368 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  39.22 
 
 		 982 aa  93.2  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  57.53 
 
 		 294 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  57.53 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  34.69 
 
 		 526 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  52.5 
 
 		 390 aa  91.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.71 
 
 		 1321 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  32.18 
 
 		 1132 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  52.86 
 
 		 479 aa  90.5  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  35.37 
 
 		 1004 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  37.89 
 
 		 1295 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  39.44 
 
 		 798 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  49.43 
 
 		 110 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  40.8 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  28.34 
 
 		 349 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  31.71 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.51 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  37.76 
 
 		 1024 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  28 
 
 		 759 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  40.91 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  33.71 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  33.15 
 
 		 855 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.24 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  31.48 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  30.52 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  64.15 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  37.33 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  32.08 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  30.94 
 
 		 948 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  29.77 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>