183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0078 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  79.13 
 
 		 522 aa  665    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1234 aa  2460    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  39.85 
 
 		 1799 aa  436  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  36.68 
 
 		 1262 aa  399  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  44.19 
 
 		 1035 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  37.05 
 
 		 930 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  44.88 
 
 		 468 aa  295  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  55.83 
 
 		 378 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  50.81 
 
 		 828 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  55.86 
 
 		 749 aa  234  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  41.44 
 
 		 954 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  50.88 
 
 		 329 aa  210  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  44.4 
 
 		 576 aa  204  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  36.36 
 
 		 966 aa  179  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  43.24 
 
 		 353 aa  172  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  47.03 
 
 		 366 aa  169  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  52.6 
 
 		 581 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 802 aa  152  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  51.63 
 
 		 823 aa  152  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  51.39 
 
 		 870 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  49.31 
 
 		 2554 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  39.29 
 
 		 374 aa  149  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  33.24 
 
 		 1707 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  49.65 
 
 		 1732 aa  147  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  48.68 
 
 		 1356 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  53.59 
 
 		 735 aa  146  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  48.65 
 
 		 840 aa  145  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  50.35 
 
 		 845 aa  145  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  48.32 
 
 		 819 aa  144  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  49.42 
 
 		 777 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  48.67 
 
 		 1380 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  47.22 
 
 		 3295 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.13 
 
 		 1132 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  48.15 
 
 		 719 aa  141  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  31.55 
 
 		 526 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  42.53 
 
 		 875 aa  140  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  47.85 
 
 		 627 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  50.67 
 
 		 786 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  35.98 
 
 		 374 aa  132  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  35.71 
 
 		 358 aa  127  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  34.59 
 
 		 918 aa  126  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  44.71 
 
 		 919 aa  125  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1167 aa  124  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  38.64 
 
 		 255 aa  124  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.48 
 
 		 569 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.61 
 
 		 982 aa  121  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.53 
 
 		 1321 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  40.24 
 
 		 801 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  37.32 
 
 		 401 aa  118  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  43.79 
 
 		 1387 aa  116  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  29.53 
 
 		 1338 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  34.07 
 
 		 368 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  43.54 
 
 		 739 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  36.32 
 
 		 311 aa  110  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  39.04 
 
 		 630 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  32.88 
 
 		 349 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  32.13 
 
 		 253 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  44.52 
 
 		 627 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  38 
 
 		 1004 aa  105  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  31.53 
 
 		 241 aa  104  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.57 
 
 		 933 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1024 aa  101  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.94 
 
 		 863 aa  100  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  43.57 
 
 		 948 aa  100  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  36.54 
 
 		 855 aa  99.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  36.49 
 
 		 798 aa  98.6  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  32.83 
 
 		 681 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  32.69 
 
 		 1295 aa  97.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  34.97 
 
 		 550 aa  94.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  28.89 
 
 		 759 aa  92.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  40.69 
 
 		 524 aa  92  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  37.24 
 
 		 972 aa  89.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.22 
 
 		 528 aa  87.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  32.72 
 
 		 500 aa  86.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  26.35 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  29.6 
 
 		 373 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  30.04 
 
 		 506 aa  83.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  21.49 
 
 		 1391 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  30.05 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  26.88 
 
 		 612 aa  81.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  36.67 
 
 		 461 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 		 1282 aa  80.5  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.25 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  23.64 
 
 		 877 aa  77.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  23.95 
 
 		 1091 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  36.46 
 
 		 726 aa  72  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3994  hypothetical protein  28.82 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  28.77 
 
 		 688 aa  70.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  33.8 
 
 		 639 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  28.84 
 
 		 345 aa  69.7  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  26.92 
 
 		 921 aa  69.3  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  28.15 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0180  lipolytic protein G-D-S-L family  26.11 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.743326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  24.91 
 
 		 679 aa  64.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.14 
 
 		 503 aa  63.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  24.8 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  31.03 
 
 		 681 aa  61.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 869 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>