31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3711 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
612 aa  1176    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  49.19 
 
 
506 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  31.38 
 
 
343 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0180  lipolytic protein G-D-S-L family  34.26 
 
 
339 aa  122  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.743326  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  32.62 
 
 
345 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  28.4 
 
 
329 aa  94  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09213  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 
847 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  25.23 
 
 
522 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  28.44 
 
 
828 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  26.88 
 
 
1234 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  27.9 
 
 
749 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  30.33 
 
 
576 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  26.64 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  27.38 
 
 
353 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  25.99 
 
 
759 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  26.29 
 
 
366 aa  65.1  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  26.07 
 
 
468 aa  64.3  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  25.66 
 
 
253 aa  60.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  26.23 
 
 
401 aa  60.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  24.29 
 
 
374 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  29.57 
 
 
921 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  26.73 
 
 
374 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  25.91 
 
 
255 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  30.69 
 
 
358 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  27.96 
 
 
349 aa  53.9  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  20.3 
 
 
681 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  25.51 
 
 
241 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  23.33 
 
 
368 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  23 
 
 
311 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  26.06 
 
 
305 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>