140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3537 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  100 
 
 		 358 aa  703    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  56.62 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  53.62 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  47.98 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  50.51 
 
 		 255 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  34.55 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  43.78 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  34.68 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  36.96 
 
 		 522 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  38.4 
 
 		 828 aa  133  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  35.8 
 
 		 1234 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  33.48 
 
 		 329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3994  hypothetical protein  34.27 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  29.57 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  32.5 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  33.67 
 
 		 468 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 		 749 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  31.95 
 
 		 576 aa  99.8  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  42.31 
 
 		 548 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  39.18 
 
 		 241 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  38.64 
 
 		 603 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  31.9 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  39.68 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  42.96 
 
 		 567 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  35.75 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  28.05 
 
 		 681 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  34.35 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  42.34 
 
 		 801 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  34.78 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.05 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  31.16 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  36.43 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  30.94 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  30.34 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  35.21 
 
 		 261 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  32.35 
 
 		 801 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  37.59 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.66 
 
 		 528 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  29.44 
 
 		 759 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.35 
 
 		 498 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.35 
 
 		 493 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  36.04 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.59 
 
 		 500 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  31.82 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  33.59 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  33.07 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  35.86 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  30.24 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  33.08 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  32.82 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  33 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  34.85 
 
 		 803 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  32.35 
 
 		 801 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.69 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  40.29 
 
 		 597 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  32.84 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  32.14 
 
 		 468 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  34.19 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  31.85 
 
 		 589 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 1282 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  33 
 
 		 890 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.71 
 
 		 933 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  30.77 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0180  lipolytic protein G-D-S-L family  38.66 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.743326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  32.8 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  30.81 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.34 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.33 
 
 		 1072 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.58 
 
 		 627 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  35.07 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  33.64 
 
 		 1207 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  33.88 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  30.35 
 
 		 612 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  24.82 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  28.24 
 
 		 215 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  35.85 
 
 		 165 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  30.77 
 
 		 417 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  30.3 
 
 		 574 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  31.58 
 
 		 275 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09213  conserved hypothetical protein  22.32 
 
 		 847 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1259  lipolytic protein G-D-S-L family  27.4 
 
 		 725 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.437163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 531 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  26.43 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.63 
 
 		 476 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  31.15 
 
 		 732 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  31.15 
 
 		 452 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  22.99 
 
 		 503 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  28.46 
 
 		 465 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  39.74 
 
 		 186 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  23.94 
 
 		 220 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  32.81 
 
 		 1128 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  26.83 
 
 		 921 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  25.89 
 
 		 227 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  27.36 
 
 		 201 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>