202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3742 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  100 
 
 		 374 aa  755    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  64.9 
 
 		 368 aa  444  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  49.62 
 
 		 401 aa  315  9e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  42.94 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  59.41 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  60.47 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  56.19 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  58.85 
 
 		 241 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  75.86 
 
 		 801 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  68 
 
 		 492 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  66.13 
 
 		 558 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  45.1 
 
 		 681 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  34.55 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  64.75 
 
 		 490 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  63.12 
 
 		 801 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  65.87 
 
 		 472 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  51.56 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  63.33 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  61.98 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  65.83 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  66.67 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  62.5 
 
 		 493 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  63.28 
 
 		 461 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  63.49 
 
 		 603 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  66.67 
 
 		 547 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  63.25 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  59.52 
 
 		 380 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  62.5 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.46 
 
 		 528 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  63.25 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  59.02 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  54.47 
 
 		 548 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  55.2 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  35.04 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  34.18 
 
 		 1234 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  38.2 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  36.84 
 
 		 828 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  53.6 
 
 		 568 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  37.85 
 
 		 688 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  45.31 
 
 		 567 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  36.27 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  35.58 
 
 		 1282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  45.8 
 
 		 709 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  34.26 
 
 		 749 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  46.92 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  30.18 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  34.51 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  31.84 
 
 		 759 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  31.71 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  47.83 
 
 		 634 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  43.85 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  44 
 
 		 803 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  33.02 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  46.77 
 
 		 801 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  37.16 
 
 		 890 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  41.13 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  30.49 
 
 		 921 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.98 
 
 		 933 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  34.15 
 
 		 255 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.11 
 
 		 627 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  31.5 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  39.02 
 
 		 597 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.87 
 
 		 1072 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  37.39 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  42.52 
 
 		 494 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  42.86 
 
 		 384 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  39.47 
 
 		 1207 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  29.78 
 
 		 503 aa  89.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  34 
 
 		 642 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  38.33 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  41.46 
 
 		 1128 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  41.22 
 
 		 1016 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.96 
 
 		 531 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  43.08 
 
 		 165 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  29.49 
 
 		 253 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  43.55 
 
 		 574 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  36.09 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  35.53 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  36.21 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  37.39 
 
 		 732 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  34.42 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04573  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  38.33 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  32.19 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 		 869 aa  76.3  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  33.77 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  31.51 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  42.97 
 
 		 824 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  38.4 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  36.09 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.31 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  35.59 
 
 		 653 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  37.12 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  36 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  34.92 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.13 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.84 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>