242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6311 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 688 aa  1364    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  42.14 
 
 		 861 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  42.24 
 
 		 760 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  32.66 
 
 		 470 aa  150  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  36.13 
 
 		 828 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  29.77 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.2 
 
 		 1372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  32.67 
 
 		 3041 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  29.47 
 
 		 681 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  30.35 
 
 		 690 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 		 1154 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  32.13 
 
 		 1308 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  34.34 
 
 		 409 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  36.96 
 
 		 374 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  30.36 
 
 		 940 aa  120  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  34.59 
 
 		 3193 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  29.17 
 
 		 417 aa  112  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.53 
 
 		 368 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  32.96 
 
 		 912 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  37.69 
 
 		 349 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  35.86 
 
 		 401 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  34.34 
 
 		 311 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  32.26 
 
 		 506 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  35.02 
 
 		 261 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  34.82 
 
 		 241 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.96 
 
 		 373 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  34.2 
 
 		 329 aa  88.6  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 		 1282 aa  85.5  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  31.25 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  32.23 
 
 		 828 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  31 
 
 		 374 aa  73.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  28.77 
 
 		 1234 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  31.28 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.89 
 
 		 1963 aa  72  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  43.81 
 
 		 1424 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04573  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.76 
 
 		 1180 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  29.07 
 
 		 522 aa  70.5  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  29.79 
 
 		 576 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  46 
 
 		 2950 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  29.08 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  28.3 
 
 		 749 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  44.12 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  29.49 
 
 		 713 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  29.31 
 
 		 713 aa  67  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.44 
 
 		 528 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  30.09 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  30.24 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  42.73 
 
 		 5094 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  44.12 
 
 		 2775 aa  65.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  41.84 
 
 		 3587 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  32.95 
 
 		 928 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  42.86 
 
 		 2911 aa  62.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  29.9 
 
 		 921 aa  62.4  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  39.81 
 
 		 782 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  27.35 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  42.17 
 
 		 1821 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  42.17 
 
 		 1543 aa  60.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  31.79 
 
 		 932 aa  60.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  34.58 
 
 		 580 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  36.73 
 
 		 574 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  36.36 
 
 		 1134 aa  60.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3404  hypothetical protein  26.37 
 
 		 534 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515631  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  37.82 
 
 		 781 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1584 aa  58.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  25.94 
 
 		 759 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.96 
 
 		 3954 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  52.38 
 
 		 7284 aa  56.6  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  34.5 
 
 		 1884 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  43.75 
 
 		 1197 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.52 
 
 		 595 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  43.62 
 
 		 3209 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  41.98 
 
 		 1764 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  55.56 
 
 		 1383 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  41.84 
 
 		 3587 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5018  Hemolysin-type calcium-binding region  35.09 
 
 		 763 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0553928  normal  0.0814089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  36.75 
 
 		 759 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 		 869 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  54.1 
 
 		 1610 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  55.36 
 
 		 2567 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  43.02 
 
 		 593 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  35.59 
 
 		 656 aa  55.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  33.82 
 
 		 595 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  39.81 
 
 		 785 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  53.85 
 
 		 2836 aa  54.7  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  41.76 
 
 		 2182 aa  54.3  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  38.71 
 
 		 1631 aa  54.3  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  57.89 
 
 		 1712 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  32.06 
 
 		 1610 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  53.45 
 
 		 677 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  29.81 
 
 		 189 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.65 
 
 		 1795 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  40.35 
 
 		 1421 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  32.39 
 
 		 942 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 2105 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  28.75 
 
 		 928 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  51.85 
 
 		 517 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  55.56 
 
 		 2097 aa  52  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 		 303 aa  51.6  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>