201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4904 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  100 
 
 		 494 aa  990    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  61.95 
 
 		 493 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  44.94 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  35 
 
 		 571 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  35.81 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  35.91 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  29.62 
 
 		 369 aa  170  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  37.63 
 
 		 422 aa  169  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  28.83 
 
 		 381 aa  164  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  31.61 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  30.43 
 
 		 1197 aa  133  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  28.07 
 
 		 345 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.44 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1278 aa  105  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  36.6 
 
 		 1413 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  38.26 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  39.72 
 
 		 566 aa  96.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  27.32 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.08 
 
 		 756 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.55 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  39.47 
 
 		 582 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  39.86 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.67 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  38.41 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  35.81 
 
 		 411 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.81 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.37 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  36.18 
 
 		 737 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  38.67 
 
 		 794 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  38.62 
 
 		 1139 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  30.99 
 
 		 497 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  26.2 
 
 		 360 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  46.32 
 
 		 943 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  36.43 
 
 		 503 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  32.45 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.22 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  36.88 
 
 		 492 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  39.01 
 
 		 824 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  38.67 
 
 		 647 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  36.96 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  35.46 
 
 		 982 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  39.23 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  38.62 
 
 		 863 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  37.5 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  33.79 
 
 		 548 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  36.81 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  36.81 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  36.81 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  36.81 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  36.81 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  32.62 
 
 		 884 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  34.29 
 
 		 672 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  35.09 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.13 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.42 
 
 		 1016 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 957 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.51 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  31.85 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  39.13 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.1 
 
 		 2073 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  31.79 
 
 		 576 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.59 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  35 
 
 		 1577 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  35 
 
 		 806 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.1 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.25 
 
 		 648 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  50.57 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  39.1 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  31.52 
 
 		 789 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  35.53 
 
 		 801 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  38.17 
 
 		 801 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.61 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  33.1 
 
 		 771 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.39 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.17 
 
 		 498 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  44.27 
 
 		 1347 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  37.4 
 
 		 472 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.33 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  32.24 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  37.12 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  44.71 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.49 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  32.17 
 
 		 558 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  24.65 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.28 
 
 		 695 aa  70.1  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  42.73 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  29.88 
 
 		 1141 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  35.88 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 230 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.65 
 
 		 963 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  38.36 
 
 		 748 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  33.09 
 
 		 897 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.12 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.64 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  34.78 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>