163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3582 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  100 
 
 
492 aa  985    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  64.69 
 
 
479 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  43.33 
 
 
386 aa  270  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  41.81 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  42.61 
 
 
614 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  66.67 
 
 
890 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  43.75 
 
 
385 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  63.64 
 
 
801 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  64.52 
 
 
1072 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  62.81 
 
 
634 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.83 
 
 
933 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  55.41 
 
 
373 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  60.8 
 
 
446 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  61.16 
 
 
384 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  58.59 
 
 
732 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  60.33 
 
 
452 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  50 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  54.69 
 
 
803 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.58 
 
 
627 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  54.69 
 
 
1207 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  52.38 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  41.48 
 
 
1128 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  47.93 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  44.92 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  48.31 
 
 
558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  45.3 
 
 
489 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  49.59 
 
 
391 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  32.29 
 
 
589 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  46.51 
 
 
709 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  44.7 
 
 
801 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  44.76 
 
 
490 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.95 
 
 
493 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.28 
 
 
498 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  47.86 
 
 
423 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  41.94 
 
 
414 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  47.37 
 
 
469 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  46.22 
 
 
603 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  43.7 
 
 
522 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  44.88 
 
 
451 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  42.37 
 
 
492 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  43.7 
 
 
488 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  45.3 
 
 
497 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  42.06 
 
 
368 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  35 
 
 
374 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  43.8 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  43.8 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  41.74 
 
 
801 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  42.15 
 
 
568 aa  96.7  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  41.32 
 
 
547 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  41.18 
 
 
468 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  34.48 
 
 
548 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.5 
 
 
489 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.5 
 
 
815 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.5 
 
 
500 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  35.37 
 
 
567 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40 
 
 
531 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  43.85 
 
 
574 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  28 
 
 
456 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  38.94 
 
 
496 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  39.02 
 
 
535 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  40.91 
 
 
165 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  26.54 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20974 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.65 
 
 
580 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  27.1 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.559851 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  27.53 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  26.03 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  26.62 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32.14 
 
 
497 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04504  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  30.05 
 
 
632 aa  68.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.289237  normal  0.827131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.3 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  31.97 
 
 
642 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  24.07 
 
 
464 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  41.8 
 
 
1577 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  33 
 
 
358 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  32.64 
 
 
494 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  31.5 
 
 
178 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  26.15 
 
 
457 aa  64.3  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  34.25 
 
 
569 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  29.51 
 
 
275 aa  63.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  24.34 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  40.51 
 
 
474 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.87 
 
 
794 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  32.45 
 
 
503 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  20.38 
 
 
535 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  31.45 
 
 
436 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08421  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  28.19 
 
 
452 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.259019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  37.8 
 
 
468 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  37.97 
 
 
487 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  34.19 
 
 
653 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  36.51 
 
 
495 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 
571 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  30.17 
 
 
597 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  29.33 
 
 
644 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  32.72 
 
 
186 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  33.6 
 
 
2615 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  28.29 
 
 
503 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  23.73 
 
 
358 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  33.55 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>