187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3580 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  100 
 
 
373 aa  753    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  44.44 
 
 
368 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  41.48 
 
 
374 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  35.29 
 
 
401 aa  176  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  64.34 
 
 
801 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  41.81 
 
 
1282 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  61.98 
 
 
479 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  59.84 
 
 
492 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.02 
 
 
933 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  45.64 
 
 
349 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  43 
 
 
241 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  40.59 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  43.59 
 
 
261 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  57.48 
 
 
803 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  52.85 
 
 
890 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.24 
 
 
1072 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  33.68 
 
 
366 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  49.15 
 
 
634 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  30.68 
 
 
921 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  31.02 
 
 
869 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  49.14 
 
 
423 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  35.65 
 
 
681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  48.74 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  48.31 
 
 
1128 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  48.67 
 
 
1207 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.41 
 
 
627 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  34.93 
 
 
759 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  48.72 
 
 
489 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  44.72 
 
 
426 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.68 
 
 
528 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  42.38 
 
 
417 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  46.46 
 
 
492 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  50.88 
 
 
446 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  47.9 
 
 
732 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  47.86 
 
 
558 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  44 
 
 
516 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04573  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751469  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  44.44 
 
 
548 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  46.61 
 
 
452 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  43.62 
 
 
490 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  47.01 
 
 
603 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  41.09 
 
 
709 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  29.38 
 
 
358 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  42.86 
 
 
801 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.14 
 
 
493 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  44.88 
 
 
469 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  41.03 
 
 
522 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  45.08 
 
 
568 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  32.54 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  45.22 
 
 
801 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  45.83 
 
 
472 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  46.15 
 
 
468 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  45.83 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  43.31 
 
 
589 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  46.15 
 
 
497 aa  92.8  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  42.5 
 
 
391 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  40.17 
 
 
488 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  40.34 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  31.31 
 
 
749 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  31.66 
 
 
688 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.17 
 
 
498 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.38 
 
 
489 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  32.55 
 
 
828 aa  86.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  31.28 
 
 
522 aa  86.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  29.33 
 
 
1234 aa  86.3  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  45 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  30.66 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  41.27 
 
 
461 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  37.31 
 
 
567 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  34 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.33 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  42.5 
 
 
547 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  41.8 
 
 
535 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  38.33 
 
 
1577 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  33.33 
 
 
642 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.4 
 
 
815 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  38.46 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  31.36 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  27.4 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  37.17 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  27.9 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  31.9 
 
 
576 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.85 
 
 
476 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  31.34 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  29.96 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  38.78 
 
 
574 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  33.33 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  35.9 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  37.96 
 
 
436 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  35.54 
 
 
794 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  41.25 
 
 
468 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.24 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  36.75 
 
 
653 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.65 
 
 
531 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  44.19 
 
 
824 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.61 
 
 
497 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  36.15 
 
 
495 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  35.38 
 
 
1413 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  31.2 
 
 
178 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  35.64 
 
 
459 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>