178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4872 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  68.29 
 
 
469 aa  665    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  100 
 
 
489 aa  985    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  41.81 
 
 
494 aa  316  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  40 
 
 
491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3804  Ricin B lectin  38.88 
 
 
497 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404288  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  37.14 
 
 
497 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  72 
 
 
492 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  63.33 
 
 
374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  60.34 
 
 
801 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  61.6 
 
 
500 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  61.42 
 
 
461 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  59.52 
 
 
380 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  58.26 
 
 
558 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  56.52 
 
 
490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  59.2 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  59.2 
 
 
498 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  58.27 
 
 
801 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  57.48 
 
 
493 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  48.68 
 
 
368 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  60 
 
 
535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  56.8 
 
 
547 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  58.2 
 
 
468 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  56.8 
 
 
489 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  58.26 
 
 
589 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  51.64 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  54.4 
 
 
451 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  56.2 
 
 
603 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  50.39 
 
 
548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  54.03 
 
 
568 aa  126  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  51.75 
 
 
634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  53.23 
 
 
801 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  47.29 
 
 
479 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  46.27 
 
 
803 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  47.93 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  45.3 
 
 
492 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  39.24 
 
 
890 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  42.65 
 
 
516 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  46.03 
 
 
373 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.11 
 
 
933 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.9 
 
 
1072 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  40.46 
 
 
709 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 
391 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  42.61 
 
 
426 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  49.12 
 
 
384 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  41.46 
 
 
446 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  49.12 
 
 
417 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.5 
 
 
627 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  45.61 
 
 
732 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  46.02 
 
 
452 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  41.74 
 
 
414 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  46.55 
 
 
574 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  40.35 
 
 
1128 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  44.83 
 
 
423 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.72 
 
 
531 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  35.9 
 
 
496 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  41.13 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  36.25 
 
 
1207 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  39.02 
 
 
597 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  39.34 
 
 
642 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.41 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  41.32 
 
 
165 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  38.24 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.54 
 
 
580 aa  80.9  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  33.33 
 
 
488 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.36 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  38.05 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  36.36 
 
 
569 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  34.11 
 
 
522 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  38.4 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.96 
 
 
503 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  42.97 
 
 
824 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  39.34 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  38.6 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  37.4 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.35 
 
 
756 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  31.84 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.33 
 
 
648 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  45 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  35.88 
 
 
1016 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  32.02 
 
 
493 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  38.4 
 
 
1139 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  39.34 
 
 
495 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  36.64 
 
 
794 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.75 
 
 
815 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  36.3 
 
 
691 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.4 
 
 
520 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.33 
 
 
1259 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  27.54 
 
 
653 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  30.77 
 
 
178 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.87 
 
 
482 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  31.25 
 
 
459 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  37.14 
 
 
618 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  35 
 
 
1577 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  32.31 
 
 
230 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  34.92 
 
 
672 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  34.17 
 
 
576 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.12 
 
 
644 aa  60.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0982  hypothetical protein  37.1 
 
 
194 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  34.39 
 
 
2615 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  33.06 
 
 
382 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>