122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5223 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  100 
 
 		 627 aa  1255    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.11 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.9 
 
 		 489 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.4 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.27 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  57.43 
 
 		 519 aa  360  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  53.97 
 
 		 499 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  50.68 
 
 		 635 aa  330  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  57.51 
 
 		 479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  53.71 
 
 		 510 aa  318  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  44.58 
 
 		 632 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2258  xylan 1,4-beta-xylosidase  44.35 
 
 		 1102 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219101  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.07 
 
 		 1072 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  43.61 
 
 		 1207 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  38.35 
 
 		 1128 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  58.33 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  56.3 
 
 		 890 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.33 
 
 		 933 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  56.19 
 
 		 446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  40 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  48.41 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  41.88 
 
 		 732 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  49.59 
 
 		 801 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  41.88 
 
 		 452 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  50.42 
 
 		 634 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  40 
 
 		 603 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  49.15 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  48.53 
 
 		 417 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  48.15 
 
 		 803 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  38.1 
 
 		 479 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  44.54 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  41.88 
 
 		 489 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  42.98 
 
 		 423 aa  95.1  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  47.71 
 
 		 391 aa  94  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  47.06 
 
 		 374 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  43.08 
 
 		 368 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  40.65 
 
 		 426 aa  91.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  36.05 
 
 		 469 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  41.8 
 
 		 558 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  35.84 
 
 		 461 aa  87.8  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  42.74 
 
 		 801 aa  87.4  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  34.25 
 
 		 490 aa  87  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  37.11 
 
 		 548 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  36.84 
 
 		 801 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  39.02 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  41.53 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  39.52 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  39.84 
 
 		 547 aa  83.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.24 
 
 		 815 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  37.13 
 
 		 380 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  39.67 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  33.02 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  35.71 
 
 		 567 aa  80.9  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  33.13 
 
 		 568 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  34.55 
 
 		 451 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  34.12 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  39.32 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  35.82 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  40.2 
 
 		 589 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2713  hypothetical protein  45.35 
 
 		 679 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.442096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  30.49 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  38.79 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  37.19 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  38.21 
 
 		 165 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.43 
 
 		 531 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.92 
 
 		 580 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  31.86 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  34.26 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  36.44 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.46 
 
 		 794 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  37.08 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  26.38 
 
 		 644 aa  57  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  30.66 
 
 		 275 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  34.65 
 
 		 824 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  42.67 
 
 		 468 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  29.17 
 
 		 806 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  29.17 
 
 		 806 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  29.17 
 
 		 806 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.17 
 
 		 806 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  27.31 
 
 		 806 aa  54.7  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  38.14 
 
 		 494 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  29.17 
 
 		 806 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  29.17 
 
 		 806 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.17 
 
 		 806 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  40.91 
 
 		 239 aa  54.3  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  32.8 
 
 		 358 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.05 
 
 		 487 aa  53.9  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.28 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  33.86 
 
 		 1100 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  33.83 
 
 		 1016 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  37.93 
 
 		 240 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  26.38 
 
 		 186 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  29.13 
 
 		 178 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0982  hypothetical protein  32 
 
 		 194 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.12 
 
 		 494 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  31.01 
 
 		 597 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.64 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.2 
 
 		 648 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  30.36 
 
 		 571 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  24.42 
 
 		 858 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>