13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2713 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2713  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1365    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.442096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.49 
 
 		 635 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  44.09 
 
 		 632 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  45.35 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.84 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.94 
 
 		 493 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.35 
 
 		 627 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.98 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  46.51 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.35 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.16 
 
 		 498 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.86 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2258  xylan 1,4-beta-xylosidase  38.05 
 
 		 1102 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219101  normal  0.0256212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>