179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4927 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  100 
 
 
498 aa  1002    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  71.78 
 
 
489 aa  665    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  61.51 
 
 
493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  80.56 
 
 
519 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  59.08 
 
 
500 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  83.01 
 
 
479 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  69.81 
 
 
510 aa  440  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.2 
 
 
627 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2258  xylan 1,4-beta-xylosidase  54.19 
 
 
1102 aa  352  7e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219101  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  54.57 
 
 
499 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  50.63 
 
 
635 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  45.92 
 
 
632 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  88.55 
 
 
801 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  87.79 
 
 
490 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  87.4 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  75.19 
 
 
461 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  73.81 
 
 
451 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  73.81 
 
 
468 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  71.43 
 
 
547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  72.22 
 
 
380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  65.83 
 
 
374 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  63.78 
 
 
492 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  60.66 
 
 
558 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  62.9 
 
 
469 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  61.02 
 
 
801 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  63.41 
 
 
603 aa  153  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  60 
 
 
535 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  59.2 
 
 
489 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  55.22 
 
 
589 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  49.62 
 
 
368 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  46.45 
 
 
548 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  52 
 
 
497 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  47.5 
 
 
634 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  51.2 
 
 
568 aa  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  44.78 
 
 
492 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  43.6 
 
 
801 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  40.13 
 
 
567 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  44.03 
 
 
479 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.92 
 
 
933 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  42.62 
 
 
516 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  42.97 
 
 
803 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  42.06 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  39.26 
 
 
890 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  38.14 
 
 
426 aa  97.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  44.72 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  38.06 
 
 
709 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  43.85 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.67 
 
 
1072 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  38.73 
 
 
414 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  45.83 
 
 
732 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  45.83 
 
 
384 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  31.97 
 
 
642 aa  90.1  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  42.5 
 
 
1207 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  42.5 
 
 
452 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.05 
 
 
531 aa  87  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  43.22 
 
 
417 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  41.46 
 
 
165 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  38.81 
 
 
494 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  38.41 
 
 
574 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  45.52 
 
 
824 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  38.46 
 
 
275 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  40.5 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.71 
 
 
494 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.71 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  47.73 
 
 
1016 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  37.9 
 
 
436 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  31.94 
 
 
597 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  36.89 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2713  hypothetical protein  43.52 
 
 
679 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.442096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  34.19 
 
 
496 aa  74.7  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  33.88 
 
 
522 aa  74.3  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.8 
 
 
520 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  35.66 
 
 
1128 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  34.65 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  33.17 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.46 
 
 
695 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.09 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.22 
 
 
476 aa  70.1  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.68 
 
 
580 aa  70.1  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  37.31 
 
 
957 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  35.43 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  37.3 
 
 
495 aa  67  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  36.57 
 
 
884 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.05 
 
 
756 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  33.58 
 
 
653 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.65 
 
 
503 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  33.86 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.07 
 
 
815 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  35.29 
 
 
1577 aa  63.9  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  30.71 
 
 
571 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  32.58 
 
 
411 aa  63.9  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 
571 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.07 
 
 
487 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  31.08 
 
 
569 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  31.54 
 
 
794 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  34.09 
 
 
1139 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  31.98 
 
 
806 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.98 
 
 
806 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  41.56 
 
 
943 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>