35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7478 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 		 635 aa  1279    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  69.34 
 
 		 632 aa  872    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  59.08 
 
 		 493 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  63.3 
 
 		 682 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.26 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.68 
 
 		 627 aa  317  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.72 
 
 		 489 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  48.9 
 
 		 519 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.59 
 
 		 498 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  45.67 
 
 		 510 aa  290  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.65 
 
 		 499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.85 
 
 		 479 aa  283  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2258  xylan 1,4-beta-xylosidase  41.29 
 
 		 1102 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219101  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  73.44 
 
 		 1357 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  73.44 
 
 		 1176 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  71.88 
 
 		 723 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  56 
 
 		 542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  54.76 
 
 		 384 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  56.67 
 
 		 438 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  50.4 
 
 		 358 aa  113  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  50.79 
 
 		 459 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2713  hypothetical protein  29.49 
 
 		 679 aa  90.9  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.442096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.51 
 
 		 673 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.23 
 
 		 734 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.96 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  29.6 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.04 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  31.03 
 
 		 1115 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  31.62 
 
 		 639 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  34.58 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  29.33 
 
 		 182 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  29.33 
 
 		 182 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  29.33 
 
 		 182 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>