13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2258 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2258  xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 		 1102 aa  2228    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219101  normal  0.0256212 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  57.14 
 
 		 510 aa  370  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  57.06 
 
 		 479 aa  352  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  57.1 
 
 		 498 aa  350  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  56.97 
 
 		 519 aa  347  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  54.41 
 
 		 489 aa  334  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.88 
 
 		 627 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.29 
 
 		 493 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.61 
 
 		 499 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.26 
 
 		 500 aa  245  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  41.29 
 
 		 635 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.89 
 
 		 632 aa  221  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2713  hypothetical protein  38.94 
 
 		 679 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.442096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>