181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3716 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 648 aa  1311    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  49.72 
 
 		 666 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  51.09 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.64 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  46.11 
 
 		 627 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  46.89 
 
 		 488 aa  412  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  44.25 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.7 
 
 		 486 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  40.24 
 
 		 634 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  45.21 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.84 
 
 		 505 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.4 
 
 		 474 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.88 
 
 		 514 aa  352  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  39.96 
 
 		 485 aa  352  8.999999999999999e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.89 
 
 		 603 aa  336  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.37 
 
 		 695 aa  331  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  35.78 
 
 		 647 aa  329  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  38.82 
 
 		 484 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  38.2 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  39.1 
 
 		 481 aa  300  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  45.35 
 
 		 603 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.33 
 
 		 501 aa  254  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  34.47 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  34 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  33.67 
 
 		 476 aa  223  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 487 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  32.14 
 
 		 982 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  31.44 
 
 		 446 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  33.72 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 441 aa  204  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 445 aa  192  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  29.73 
 
 		 447 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  31.83 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  30.72 
 
 		 447 aa  181  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  30.54 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  26.68 
 
 		 567 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  28.32 
 
 		 688 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  29.02 
 
 		 726 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  26.52 
 
 		 532 aa  108  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  27.49 
 
 		 406 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  26.5 
 
 		 413 aa  101  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  43.57 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  27.34 
 
 		 859 aa  94  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  36.99 
 
 		 1139 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  40.27 
 
 		 401 aa  88.2  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  35.77 
 
 		 672 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.3 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  38.36 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  36.99 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 1148 aa  77.4  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  36.5 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  35.57 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  35.71 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  37.25 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  23.63 
 
 		 982 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  35.77 
 
 		 430 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  32.67 
 
 		 691 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  42.06 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  35.51 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  32.87 
 
 		 569 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  37.93 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.76 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  34.97 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  41.8 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  43.61 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  41.48 
 
 		 709 aa  67.4  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  36.92 
 
 		 803 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  36.49 
 
 		 748 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  34.15 
 
 		 943 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.58 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  38.13 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  32.62 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.94 
 
 		 474 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.86 
 
 		 489 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  38.52 
 
 		 1049 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  35.66 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  35 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  24.49 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  39.1 
 
 		 801 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  37.5 
 
 		 663 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  36.5 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  33.33 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 566 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  31.76 
 
 		 571 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.33 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  27.82 
 
 		 1413 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  36.81 
 
 		 794 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  37.23 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  37.88 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  29.03 
 
 		 1259 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  36.89 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.91 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  32.7 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  31.55 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.94 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.62 
 
 		 1072 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  31.34 
 
 		 411 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.41 
 
 		 520 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  36.03 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  39.1 
 
 		 380 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>