50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0982 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0982  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  38.66 
 
 		 603 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  31.14 
 
 		 567 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.71 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  32.2 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.44 
 
 		 493 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  38.66 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  36.51 
 
 		 547 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 368 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  34.31 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  33.91 
 
 		 634 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  34.25 
 
 		 558 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.25 
 
 		 531 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  30.59 
 
 		 384 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32 
 
 		 627 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.52 
 
 		 1072 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  38.26 
 
 		 468 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.72 
 
 		 498 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  34.38 
 
 		 472 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  31.75 
 
 		 803 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.11 
 
 		 476 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  34.38 
 
 		 490 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.3 
 
 		 648 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.78 
 
 		 500 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  36.21 
 
 		 801 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  33.91 
 
 		 548 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.56 
 
 		 516 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  41.38 
 
 		 982 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  33.87 
 
 		 497 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.01 
 
 		 373 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  31.2 
 
 		 574 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  32.8 
 
 		 492 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  39.09 
 
 		 417 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  34.17 
 
 		 535 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  31.71 
 
 		 483 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  38.96 
 
 		 732 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  27.98 
 
 		 794 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.21 
 
 		 580 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  34.48 
 
 		 461 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  28.24 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  32.45 
 
 		 801 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 452 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  30.95 
 
 		 492 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  28.8 
 
 		 801 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  39.29 
 
 		 469 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  36.36 
 
 		 1100 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  31.15 
 
 		 374 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  31.15 
 
 		 653 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  38.75 
 
 		 380 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 239 aa  41.2  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>