197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4906 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  100 
 
 		 603 aa  1230    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  46.63 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.86 
 
 		 484 aa  290  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  45.64 
 
 		 648 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  41.3 
 
 		 480 aa  257  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  41.84 
 
 		 634 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.6 
 
 		 627 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.94 
 
 		 486 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  38.74 
 
 		 647 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  40.29 
 
 		 488 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  39.7 
 
 		 485 aa  240  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.61 
 
 		 474 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.56 
 
 		 666 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.94 
 
 		 505 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.1 
 
 		 514 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.72 
 
 		 603 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.77 
 
 		 497 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  39.76 
 
 		 481 aa  204  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  36.31 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  36.63 
 
 		 475 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  35.69 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.79 
 
 		 695 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  33.14 
 
 		 445 aa  186  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  34.78 
 
 		 485 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 		 487 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.76 
 
 		 501 aa  169  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  31.16 
 
 		 446 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  64.23 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  62.6 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  31.49 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  63.41 
 
 		 498 aa  153  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  60.77 
 
 		 490 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  32.84 
 
 		 481 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  60 
 
 		 801 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  63.41 
 
 		 493 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  60.66 
 
 		 461 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  61.79 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  58.2 
 
 		 558 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  56.69 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.82 
 
 		 982 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  60.98 
 
 		 500 aa  143  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  52.45 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  58.27 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  57.02 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  27.62 
 
 		 447 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  58.33 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  59.35 
 
 		 547 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  51.15 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  56.2 
 
 		 489 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  55.56 
 
 		 801 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  53.08 
 
 		 469 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  55.37 
 
 		 497 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  28.35 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  27.09 
 
 		 447 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  55.28 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  46.3 
 
 		 589 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  49.17 
 
 		 803 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  48.25 
 
 		 801 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  47.62 
 
 		 567 aa  114  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  41.88 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  46.22 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  50.82 
 
 		 568 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  44.96 
 
 		 516 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  39.79 
 
 		 709 aa  107  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40 
 
 		 627 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  40.33 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  43.7 
 
 		 890 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  46.77 
 
 		 446 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  47.01 
 
 		 373 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  24.02 
 
 		 567 aa  97.1  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.44 
 
 		 933 aa  97.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.53 
 
 		 1072 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  38.1 
 
 		 426 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  43.48 
 
 		 417 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  43.51 
 
 		 384 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  43.97 
 
 		 1207 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  41.53 
 
 		 732 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  42.97 
 
 		 574 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  29.81 
 
 		 859 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  26.33 
 
 		 413 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  38.17 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  36 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  42.02 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.75 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  36.89 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  31.67 
 
 		 642 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  40.98 
 
 		 165 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  25.16 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.89 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  34.57 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.98 
 
 		 580 aa  76.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  35.51 
 
 		 1016 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  33.33 
 
 		 1128 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  35.43 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  31.9 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.59 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  37.82 
 
 		 824 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>