135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6745 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  100 
 
 
653 aa  1340    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  48.43 
 
 
524 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  37.94 
 
 
350 aa  193  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  38.51 
 
 
353 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  36.81 
 
 
354 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  27.09 
 
 
423 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  28.84 
 
 
417 aa  94  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  28 
 
 
414 aa  90.1  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.02 
 
 
627 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  26.3 
 
 
410 aa  79  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.09 
 
 
1072 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  34.15 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  25.61 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  38.46 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  35.59 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  38.33 
 
 
801 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  34.96 
 
 
801 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  26.56 
 
 
806 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  26.56 
 
 
806 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  26.56 
 
 
806 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.56 
 
 
806 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  36.75 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  35.9 
 
 
890 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  26.14 
 
 
806 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  26.14 
 
 
806 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  26.14 
 
 
806 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 
806 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  29.59 
 
 
634 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  35.59 
 
 
558 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  25.57 
 
 
416 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  23.56 
 
 
397 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  35.29 
 
 
479 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.36 
 
 
489 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.68 
 
 
498 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  26.04 
 
 
418 aa  65.1  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  26.52 
 
 
1207 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  34.45 
 
 
803 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  27.33 
 
 
589 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  35.59 
 
 
489 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  32.76 
 
 
603 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  35.96 
 
 
423 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  33.33 
 
 
548 aa  62.4  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  32.77 
 
 
468 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  29.91 
 
 
801 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.34 
 
 
933 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  27.52 
 
 
305 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  35.25 
 
 
568 aa  61.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  29.91 
 
 
490 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  26.01 
 
 
353 aa  61.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  36.54 
 
 
446 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.94 
 
 
493 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.4 
 
 
531 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  34.19 
 
 
492 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  29.06 
 
 
472 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  25.13 
 
 
858 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.13 
 
 
858 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  26.74 
 
 
323 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  25.13 
 
 
805 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  25.13 
 
 
807 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  25.13 
 
 
800 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  25.13 
 
 
800 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  36.9 
 
 
165 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30 
 
 
497 aa  57.4  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  24.2 
 
 
446 aa  57.4  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  24.61 
 
 
858 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  33.88 
 
 
496 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.62 
 
 
500 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  24.67 
 
 
413 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  32.43 
 
 
414 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  26.79 
 
 
426 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  30.95 
 
 
492 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  30.89 
 
 
535 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  27.41 
 
 
1128 aa  55.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.45 
 
 
488 aa  54.7  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  35.05 
 
 
1000 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  24.36 
 
 
644 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  31.67 
 
 
547 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  27.36 
 
 
367 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  35.14 
 
 
275 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  30.77 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  38.64 
 
 
240 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  34.17 
 
 
522 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  29.93 
 
 
1577 aa  53.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  30 
 
 
567 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  25.09 
 
 
259 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  32.77 
 
 
574 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  27.33 
 
 
436 aa  51.2  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  26.83 
 
 
494 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  23.96 
 
 
494 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  27.56 
 
 
380 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  22.78 
 
 
1349 aa  50.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  32.29 
 
 
186 aa  50.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  31.71 
 
 
451 aa  50.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  35.87 
 
 
618 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  25.71 
 
 
482 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  26.06 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  25 
 
 
737 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  39.47 
 
 
384 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  25.81 
 
 
824 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 
391 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>