79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0039 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  100 
 
 		 1000 aa  1983    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  71.71 
 
 		 1100 aa  1274    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  43.22 
 
 		 858 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  43.22 
 
 		 805 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  43.22 
 
 		 800 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  43.06 
 
 		 858 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  42.74 
 
 		 858 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  43.22 
 
 		 800 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  44.62 
 
 		 806 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  44.62 
 
 		 806 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  42.92 
 
 		 807 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  44.62 
 
 		 806 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  44.62 
 
 		 806 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  44.62 
 
 		 806 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  44.46 
 
 		 806 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  44.62 
 
 		 806 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  44.96 
 
 		 806 aa  466  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  48.76 
 
 		 638 aa  442  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  42.51 
 
 		 1222 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  42.92 
 
 		 1567 aa  366  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  33.07 
 
 		 593 aa  208  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  28.7 
 
 		 918 aa  206  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  31.18 
 
 		 781 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  31.37 
 
 		 781 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  29.48 
 
 		 797 aa  145  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  29.53 
 
 		 759 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  26.35 
 
 		 909 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  26.35 
 
 		 947 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  28.52 
 
 		 831 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  25.97 
 
 		 517 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  27.25 
 
 		 671 aa  85.5  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  23.85 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  23.85 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  31.65 
 
 		 1016 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  24.91 
 
 		 650 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  27.83 
 
 		 757 aa  76.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.2 
 
 		 482 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.85 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  30.5 
 
 		 691 aa  61.2  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  30.66 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  34.31 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  28.65 
 
 		 803 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.39 
 
 		 507 aa  56.2  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  29.1 
 
 		 576 aa  55.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  25.97 
 
 		 366 aa  55.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0156  Ricin B lectin  29.68 
 
 		 187 aa  54.3  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151088  normal  0.0518201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  35.05 
 
 		 653 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.34 
 
 		 476 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.43 
 
 		 520 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  31.65 
 
 		 794 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  34.74 
 
 		 427 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  25.97 
 
 		 631 aa  53.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.71 
 
 		 957 aa  52.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  31.11 
 
 		 401 aa  51.6  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  29.8 
 
 		 726 aa  51.6  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  27.32 
 
 		 1148 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  26.47 
 
 		 303 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  30.15 
 
 		 672 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  35.92 
 
 		 496 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  32.17 
 
 		 642 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  27.54 
 
 		 884 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  30.37 
 
 		 430 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.95 
 
 		 466 aa  48.9  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.24 
 
 		 943 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  26.09 
 
 		 436 aa  48.5  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 		 756 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  26.95 
 
 		 450 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  23.74 
 
 		 377 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  27.1 
 
 		 586 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  26.24 
 
 		 646 aa  47  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  27.27 
 
 		 448 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  30.21 
 
 		 644 aa  45.8  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  27.11 
 
 		 494 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  26.95 
 
 		 748 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  30.69 
 
 		 771 aa  45.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  29.5 
 
 		 239 aa  45.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 368 aa  44.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  25.55 
 
 		 589 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.77 
 
 		 695 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>