95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1832 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  88.89 
 
 
450 aa  691    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  100 
 
 
448 aa  849    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  97.99 
 
 
484 aa  747    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  42.82 
 
 
646 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  38.36 
 
 
377 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  42.11 
 
 
366 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  41.18 
 
 
642 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  35.53 
 
 
605 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  36.39 
 
 
833 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  38.73 
 
 
586 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  34.12 
 
 
1245 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  37.63 
 
 
382 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  28.49 
 
 
1744 aa  96.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  35.69 
 
 
487 aa  86.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  26.56 
 
 
445 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  36.05 
 
 
179 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.07 
 
 
1762 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  27.6 
 
 
593 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  24.82 
 
 
1222 aa  66.6  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  35.04 
 
 
154 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  23.42 
 
 
918 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  28.25 
 
 
807 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.68 
 
 
858 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.68 
 
 
858 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 
312 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  27.12 
 
 
858 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  27.68 
 
 
800 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  27.68 
 
 
800 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  27.68 
 
 
805 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  30.67 
 
 
781 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  30.67 
 
 
781 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.24 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  32.67 
 
 
483 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.43 
 
 
812 aa  60.5  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  27.27 
 
 
341 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  25 
 
 
488 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.81 
 
 
2942 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2488  hypothetical protein  31.63 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  32.28 
 
 
1567 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  29.8 
 
 
1017 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
1009 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  29.8 
 
 
1009 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  24.62 
 
 
471 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  25.81 
 
 
806 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
454 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  26.46 
 
 
344 aa  53.9  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.07 
 
 
321 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  27.48 
 
 
326 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  37.31 
 
 
667 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  31.37 
 
 
759 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  25.67 
 
 
776 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  30.48 
 
 
831 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 
317 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  23.38 
 
 
806 aa  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  27.2 
 
 
517 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  22.66 
 
 
652 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  22.66 
 
 
652 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  24.43 
 
 
671 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.15 
 
 
675 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  27.84 
 
 
514 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  28.87 
 
 
236 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  24.72 
 
 
1656 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  27.37 
 
 
334 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 
954 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  24.05 
 
 
910 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.22 
 
 
1364 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  31.82 
 
 
1514 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  25.14 
 
 
909 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  26.2 
 
 
577 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 
508 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  25.44 
 
 
180 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  25.14 
 
 
947 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  27.4 
 
 
990 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  33.81 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4720  hypothetical protein  37.5 
 
 
473 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  26.05 
 
 
797 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  26.53 
 
 
638 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  26.17 
 
 
693 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  29.52 
 
 
993 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  32.91 
 
 
1557 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  28.29 
 
 
321 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  32 
 
 
757 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  26.85 
 
 
1100 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  30.83 
 
 
497 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03470  expressed protein  36.84 
 
 
1146 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6735  WD-40 repeat protein  28.99 
 
 
624 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.24 
 
 
919 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  26.52 
 
 
494 aa  43.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>