139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1097 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  45.41 
 
 		 1608 aa  878    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 1557 aa  3167    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  39.1 
 
 		 445 aa  173  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2396  hypothetical protein  30.04 
 
 		 616 aa  165  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000510296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  30.33 
 
 		 776 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.8 
 
 		 1762 aa  145  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  29.9 
 
 		 312 aa  136  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  30.74 
 
 		 344 aa  128  8.000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  33.1 
 
 		 2942 aa  126  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  29.04 
 
 		 341 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  32.3 
 
 		 321 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  26.74 
 
 		 1017 aa  112  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 		 1009 aa  111  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  26.39 
 
 		 1009 aa  111  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 454 aa  111  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  33.46 
 
 		 321 aa  110  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  35.21 
 
 		 339 aa  107  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  32.02 
 
 		 317 aa  105  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  27.46 
 
 		 373 aa  105  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 471 aa  104  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  31.25 
 
 		 314 aa  102  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  25.5 
 
 		 993 aa  100  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  30.32 
 
 		 508 aa  100  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  27.71 
 
 		 642 aa  98.6  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  31.8 
 
 		 236 aa  97.8  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  29.19 
 
 		 430 aa  95.9  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.43 
 
 		 990 aa  90.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  29.15 
 
 		 326 aa  90.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 461 aa  89.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  25.05 
 
 		 1656 aa  89  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  27.67 
 
 		 321 aa  89  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  28.1 
 
 		 2528 aa  88.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  31.77 
 
 		 318 aa  87.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  26.76 
 
 		 586 aa  86.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.8 
 
 		 693 aa  84  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  32.95 
 
 		 334 aa  84  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  30.48 
 
 		 795 aa  84  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.23 
 
 		 812 aa  80.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  28.9 
 
 		 180 aa  78.6  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 		 1453 aa  78.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  28.38 
 
 		 346 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  23.72 
 
 		 1407 aa  77  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  28.04 
 
 		 717 aa  76.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  23.37 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  34.97 
 
 		 280 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  25.27 
 
 		 377 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  26.49 
 
 		 646 aa  71.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  24.4 
 
 		 483 aa  70.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  24.36 
 
 		 366 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 1451 aa  70.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1514 aa  70.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  23.75 
 
 		 497 aa  70.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  26.47 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  27.52 
 
 		 339 aa  68.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  30.29 
 
 		 368 aa  67  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  29.08 
 
 		 346 aa  66.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  26.55 
 
 		 335 aa  64.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  26.5 
 
 		 831 aa  64.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.39 
 
 		 668 aa  62.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  27.53 
 
 		 1461 aa  62.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  31.87 
 
 		 368 aa  61.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  31.87 
 
 		 368 aa  61.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  24.58 
 
 		 382 aa  61.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  31.87 
 
 		 368 aa  61.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  31.87 
 
 		 368 aa  61.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  31.87 
 
 		 368 aa  61.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  31.87 
 
 		 368 aa  61.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  22.94 
 
 		 639 aa  61.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  30.72 
 
 		 368 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  22.12 
 
 		 506 aa  60.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.29 
 
 		 930 aa  58.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  26.54 
 
 		 605 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1678  hypothetical protein  42.5 
 
 		 940 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507171  hitchhiker  0.000632186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  36.23 
 
 		 709 aa  57.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  38.04 
 
 		 391 aa  57.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  26.02 
 
 		 358 aa  57  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  24.7 
 
 		 514 aa  57  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  25.81 
 
 		 396 aa  56.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  25.87 
 
 		 595 aa  56.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  34.09 
 
 		 676 aa  56.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  31.05 
 
 		 1146 aa  55.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.59 
 
 		 927 aa  55.5  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  24.83 
 
 		 1474 aa  53.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.48 
 
 		 725 aa  54.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 1556 aa  53.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1744 aa  54.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  31.91 
 
 		 522 aa  53.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  22.73 
 
 		 698 aa  53.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  20.38 
 
 		 667 aa  52.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1163 aa  53.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  36.25 
 
 		 1965 aa  52.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.5 
 
 		 387 aa  52  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.28 
 
 		 752 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  22.58 
 
 		 557 aa  50.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  25.7 
 
 		 588 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  38.82 
 
 		 969 aa  50.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  26.92 
 
 		 1114 aa  50.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  40.28 
 
 		 2286 aa  50.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 621 aa  50.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.91 
 
 		 746 aa  50.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>