87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4136 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  100 
 
 
605 aa  1214    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  43.27 
 
 
646 aa  197  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  38.97 
 
 
366 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  40.38 
 
 
1245 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  38.73 
 
 
833 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  35.82 
 
 
450 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  36.1 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  35.82 
 
 
448 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  36.3 
 
 
377 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  36.98 
 
 
586 aa  156  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  37.5 
 
 
642 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  37.25 
 
 
382 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  39.04 
 
 
179 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  37.56 
 
 
1744 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  25.87 
 
 
445 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0969  hypothetical protein  31.65 
 
 
323 aa  87  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.259383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  28.69 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  25.27 
 
 
517 aa  74.7  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  37.14 
 
 
1762 aa  74.3  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  35.21 
 
 
154 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  27.11 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  28.16 
 
 
667 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  26.69 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1167  hypothetical protein  27.35 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  25.8 
 
 
344 aa  67  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  24.26 
 
 
795 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  24.04 
 
 
1557 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  26.81 
 
 
341 aa  63.5  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  29.31 
 
 
776 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1199  hypothetical protein  29.55 
 
 
240 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774641  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  23.57 
 
 
334 aa  60.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  27.34 
 
 
831 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1817  hypothetical protein  27.78 
 
 
235 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  24.59 
 
 
1222 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  26.42 
 
 
807 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3522  hypothetical protein  27.8 
 
 
334 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 
858 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 
858 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  25.79 
 
 
800 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  31.48 
 
 
593 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  25.79 
 
 
805 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  25.79 
 
 
800 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  28.87 
 
 
318 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  25.79 
 
 
858 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  25.85 
 
 
797 aa  55.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  24.37 
 
 
990 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  26.84 
 
 
321 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1892  hypothetical protein  27.14 
 
 
237 aa  54.3  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328755  hitchhiker  0.00415395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
454 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  32.64 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  23.17 
 
 
488 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  26.71 
 
 
717 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  30.64 
 
 
652 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  30.64 
 
 
652 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  23.84 
 
 
671 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  24.15 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  30.77 
 
 
918 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  27.15 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  23.95 
 
 
993 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  23.65 
 
 
1567 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  27.03 
 
 
1656 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  23.75 
 
 
430 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  36.22 
 
 
759 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  26.64 
 
 
483 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
1009 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  31.58 
 
 
1009 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  24.37 
 
 
321 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  27.2 
 
 
514 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  23.77 
 
 
757 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  25.61 
 
 
508 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  30.99 
 
 
317 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  31.58 
 
 
1017 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  26.38 
 
 
781 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  25.71 
 
 
806 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  25.29 
 
 
693 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  26.38 
 
 
781 aa  44.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  22.4 
 
 
2942 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  30.77 
 
 
806 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  30.77 
 
 
806 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  30.77 
 
 
806 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  25.69 
 
 
806 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
806 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80234  carboxymethyltransferase  23.65 
 
 
692 aa  44.3  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.363907 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  24.19 
 
 
812 aa  44.3  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
806 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  30.77 
 
 
806 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  24.66 
 
 
373 aa  43.9  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>