74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3426 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 373 aa  748    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1762 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  34.15 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  34.03 
 
 		 341 aa  159  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  36.58 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  38.85 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  31.33 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  35.91 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  35.23 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  34.64 
 
 		 812 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  31.23 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1557 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  27.07 
 
 		 1656 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  30.57 
 
 		 795 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  27.36 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  28.93 
 
 		 990 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  30.69 
 
 		 1009 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 1009 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  30.69 
 
 		 1017 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  29.24 
 
 		 693 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  26.73 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  27.33 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  25.84 
 
 		 993 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  33.19 
 
 		 776 aa  95.9  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  28.18 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  30.54 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 471 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  30.2 
 
 		 586 aa  82.8  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  28.99 
 
 		 2942 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  33.16 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  26.53 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  28.12 
 
 		 1461 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  29.32 
 
 		 642 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  28.29 
 
 		 698 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1514 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1407 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  22.65 
 
 		 725 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  27.84 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  31.12 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  29.93 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  28.73 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.04 
 
 		 1453 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  28.35 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  25.82 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  27 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  26.83 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.01 
 
 		 1451 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  25.29 
 
 		 1474 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  26.41 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  28.44 
 
 		 717 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  25.86 
 
 		 557 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  23.97 
 
 		 646 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  29.19 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  27.32 
 
 		 536 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  27.32 
 
 		 536 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 		 450 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  23.13 
 
 		 1245 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  23.11 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  27.1 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  21.43 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  25.56 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  28.26 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  19.57 
 
 		 970 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  22.51 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  22.09 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  25.98 
 
 		 833 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  27.13 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  23.47 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 850 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  30.19 
 
 		 883 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.87 
 
 		 1215 aa  43.5  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>