43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1613 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  33.8 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  30.24 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  33.11 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  29.84 
 
 		 339 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1407 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  34.97 
 
 		 1557 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  26.83 
 
 		 776 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  27.78 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.05 
 
 		 795 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  28.69 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  27.37 
 
 		 990 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  26.1 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1762 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  27.65 
 
 		 812 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  22.9 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.6 
 
 		 693 aa  55.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  27.42 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 454 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25.78 
 
 		 497 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  28.73 
 
 		 353 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  31.41 
 
 		 717 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 2942 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  25.53 
 
 		 334 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  24.34 
 
 		 326 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.43 
 
 		 1453 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  26.04 
 
 		 586 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  25.45 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  24.23 
 
 		 471 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  24.77 
 
 		 373 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  27.92 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 508 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  20.86 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  20.86 
 
 		 380 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.45 
 
 		 386 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  22.45 
 
 		 386 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  26.62 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  20.97 
 
 		 483 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.77 
 
 		 392 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  25.61 
 
 		 1656 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.77 
 
 		 392 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  23.01 
 
 		 344 aa  42  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>