35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1683 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  100 
 
 
335 aa  670    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  45.57 
 
 
358 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  41 
 
 
339 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  36.08 
 
 
346 aa  192  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  30.58 
 
 
280 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  27.27 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  26.99 
 
 
1557 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  28.15 
 
 
1762 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  28.37 
 
 
1407 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  28.8 
 
 
639 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  25.49 
 
 
812 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  24.55 
 
 
693 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  29.87 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.63 
 
 
2942 aa  49.7  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 
586 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  24.62 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  23.95 
 
 
479 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  21.52 
 
 
1656 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  24.8 
 
 
642 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  30.48 
 
 
471 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  22.6 
 
 
334 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  26.21 
 
 
646 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  23.1 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  23.28 
 
 
506 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  24.24 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  25.14 
 
 
1474 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  27.92 
 
 
497 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08430  Kelch repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12780)  24.7 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.03 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.03 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
454 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  28.03 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  33.64 
 
 
1514 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 
1556 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  23.11 
 
 
776 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>