77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4451 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 326 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  54.14 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  50.68 
 
 		 1656 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  33.44 
 
 		 1461 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.46 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  31.86 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  30.66 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  32.2 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  30.85 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  28.67 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  31.38 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  30.61 
 
 		 990 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  30.9 
 
 		 1762 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  29.21 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  27.12 
 
 		 795 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  26.28 
 
 		 776 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  26.57 
 
 		 373 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1557 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 2942 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  25.08 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  24.31 
 
 		 812 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  26.94 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  24.92 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  24.32 
 
 		 993 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 		 1009 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  27.01 
 
 		 1009 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  27.01 
 
 		 1017 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  25.45 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  25.97 
 
 		 717 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  28.21 
 
 		 693 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25.82 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  23.57 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1407 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 		 1453 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  23.63 
 
 		 586 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  28.88 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.75 
 
 		 1451 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  23.84 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  31.82 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  26.02 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  25.93 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  24.47 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  25.77 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  29.38 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  29.55 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  25.38 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  21.85 
 
 		 1474 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  25 
 
 		 667 aa  52.8  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  27.48 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  20.07 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  22.98 
 
 		 698 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  24.46 
 
 		 536 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  26.24 
 
 		 484 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  24.46 
 
 		 536 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1514 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  31.47 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08430  Kelch repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12780)  21.98 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  24.15 
 
 		 605 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  24.34 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  24.62 
 
 		 588 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00813  conserved kelch repeat protein TeaB (Eurofung)  26.25 
 
 		 713 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  24.64 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  25.39 
 
 		 450 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 		 1556 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  21.48 
 
 		 483 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  30.43 
 
 		 506 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  26.54 
 
 		 376 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  22.4 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  24.34 
 
 		 514 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  24.36 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  25.96 
 
 		 557 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03470  expressed protein  23.18 
 
 		 1146 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  20.65 
 
 		 460 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>