77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4892 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 318 aa  624  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  36.24 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  38.62 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  34.56 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  34.23 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  35.88 
 
 		 812 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.57 
 
 		 1762 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  33.44 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  30 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  32.32 
 
 		 776 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  31.69 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  29.31 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  28.89 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  30 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  34.19 
 
 		 693 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  30.59 
 
 		 795 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  28.57 
 
 		 445 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.41 
 
 		 990 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  26.79 
 
 		 1656 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  31.1 
 
 		 497 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  26.07 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  28.62 
 
 		 993 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  25.53 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  31.77 
 
 		 1557 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 471 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 508 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 454 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.61 
 
 		 1453 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  30.32 
 
 		 1009 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 1009 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  29.68 
 
 		 1017 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 2942 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.71 
 
 		 1451 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  25 
 
 		 717 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 461 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1407 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  33.9 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  34.72 
 
 		 483 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  30.6 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  27.85 
 
 		 1461 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  24.24 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  30.5 
 
 		 642 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  28.22 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  24.64 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  26.45 
 
 		 698 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  29.71 
 
 		 605 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  30.6 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  28.87 
 
 		 179 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  27.23 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  30.77 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1514 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  23.84 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  31.53 
 
 		 667 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.99 
 
 		 1215 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  26.77 
 
 		 353 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  24.82 
 
 		 366 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 850 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  27.01 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  25.14 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  24 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  26.58 
 
 		 402 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  32.58 
 
 		 450 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  28.26 
 
 		 646 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  26.75 
 
 		 883 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.48 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.48 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  23.08 
 
 		 557 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.48 
 
 		 392 aa  45.8  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 484 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  33.81 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  21.62 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  23.66 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  22.18 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  24.73 
 
 		 970 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  30.08 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  26.12 
 
 		 406 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  25.5 
 
 		 154 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>