49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0025 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  100 
 
 
667 aa  1335    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0233  hypothetical protein  44.56 
 
 
409 aa  248  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  25.08 
 
 
993 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.43 
 
 
312 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
1556 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
454 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  28.76 
 
 
1017 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 
2942 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
1009 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  28.76 
 
 
1009 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  34.71 
 
 
776 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  24.9 
 
 
341 aa  59.7  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  25.27 
 
 
812 aa  57.4  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  25.59 
 
 
321 aa  57  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  26.34 
 
 
368 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  22.79 
 
 
344 aa  54.7  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  25.59 
 
 
384 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 
326 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  26.53 
 
 
314 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  20.38 
 
 
1557 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  31.32 
 
 
693 aa  52.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  24.14 
 
 
725 aa  52.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  26.78 
 
 
434 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  25.75 
 
 
795 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.16 
 
 
491 aa  50.8  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
461 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  32.37 
 
 
336 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  22.73 
 
 
366 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  20.55 
 
 
990 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  24.88 
 
 
430 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.42 
 
 
676 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  29.87 
 
 
351 aa  47.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  27.98 
 
 
346 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  22.32 
 
 
1762 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  27.39 
 
 
639 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.64 
 
 
930 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  25.16 
 
 
508 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  22.35 
 
 
1407 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  24.02 
 
 
321 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
850 aa  46.2  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  29.41 
 
 
717 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  25.62 
 
 
2374 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  23.23 
 
 
668 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  22.02 
 
 
752 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  37.36 
 
 
382 aa  44.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  31.53 
 
 
318 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  26.51 
 
 
319 aa  44.3  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  27.21 
 
 
642 aa  44.3  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  30.43 
 
 
1514 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>