20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3106 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  715    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  30.3 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  25.21 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0233  hypothetical protein  31.54 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  25 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  26.12 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  32.59 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  26.39 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  26.39 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  30.63 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  29.87 
 
 		 667 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  30.63 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  38.55 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  26.12 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  26.12 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  25.71 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  26.04 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  42.11 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  27.37 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  34.81 
 
 		 482 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>