12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0233 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  815    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  44.56 
 
 		 667 aa  249  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  25.71 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1030 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  31.54 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  29.11 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  27.94 
 
 		 366 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  24.17 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  22.6 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  24.77 
 
 		 491 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  25.4 
 
 		 579 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  31.78 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>