More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2569 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 508 aa  1002    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  36.24 
 
 		 471 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 454 aa  263  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 461 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.58 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  27.3 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  28.8 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1762 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  23.9 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  30.32 
 
 		 1557 aa  100  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  31.88 
 
 		 318 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  30.2 
 
 		 776 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.81 
 
 		 321 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  36.36 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 		 1009 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  39.47 
 
 		 1009 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  39.47 
 
 		 1017 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  30.65 
 
 		 795 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  32.38 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  38.61 
 
 		 993 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  24.92 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  27.85 
 
 		 717 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  32.35 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  32.14 
 
 		 990 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  33.85 
 
 		 2942 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  31.64 
 
 		 1514 aa  77  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  23.97 
 
 		 1656 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  25.75 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 204 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 210 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 228 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  34 
 
 		 314 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  27.03 
 
 		 321 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  26.64 
 
 		 317 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 204 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  53.73 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  53.97 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1407 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  51.61 
 
 		 907 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  53.23 
 
 		 901 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 		 907 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.12 
 
 		 244 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  50.79 
 
 		 209 aa  70.1  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  26.86 
 
 		 642 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 237 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.54 
 
 		 894 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  51.61 
 
 		 917 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  50.79 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  48.39 
 
 		 907 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  25.81 
 
 		 586 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.77 
 
 		 1019 aa  67  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  50.82 
 
 		 213 aa  67  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  30.12 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 257 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 210 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 211 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 249 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 210 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 229 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 544 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  25.29 
 
 		 321 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 544 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 236 aa  66.6  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 256 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 544 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  45.9 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1422  DNA-binding response regulator VraR  45.9 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.871667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  25.74 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  51.61 
 
 		 891 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  31.54 
 
 		 812 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>