More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1563 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 254 aa  321  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.56 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.46 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.44 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 242 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0710  two component LuxR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 240 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 246 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.74 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  40.36 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  40.36 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 224 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 		 215 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 		 217 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  39.01 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 209 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  38.67 
 
 		 209 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 224 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.29 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  37.92 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.89 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 227 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.99 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.22 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.36 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 227 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.65 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  36.44 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 209 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  38.74 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 210 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 210 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.05 
 
 		 209 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 236 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.95 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  37.5 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>