More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1863 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 216 aa  321  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 208 aa  234  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 228 aa  228  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 213 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  43.26 
 
 		 234 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.67 
 
 		 216 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  42.33 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.19 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  44.13 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  44.13 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  44.13 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  44.13 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  44.13 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  44.13 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  44.13 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 238 aa  184  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 224 aa  184  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.13 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.4 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  41.71 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  40.28 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  40.28 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  40.28 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 237 aa  178  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  43.46 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  38.71 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  41.31 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.35 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  41.23 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  41.23 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  40.76 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.37 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  42.58 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  42.18 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  39.62 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>