More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0315 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.87 
 
 		 217 aa  294  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  67.45 
 
 		 216 aa  291  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  46.95 
 
 		 213 aa  185  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 231 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  44.81 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  44.81 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  44.81 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  44.81 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  43.26 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  44.81 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  44.81 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 228 aa  178  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 		 215 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  45.71 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.75 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 303 aa  174  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  46.45 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.5 
 
 		 226 aa  171  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 241 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 242 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  41.86 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  43.6 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.15 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  40.87 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.93 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 234 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>