More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2804 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  68.04 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  66.21 
 
 		 222 aa  285  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.74 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  50.7 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.07 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.58 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.52 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  207  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.8 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.88 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  51.15 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 226 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  50.68 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 218 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.23 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 218 aa  197  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 228 aa  197  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.37 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.4 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  49.77 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  50.93 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.3 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  47.47 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.67 
 
 		 216 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 229 aa  191  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 215 aa  191  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.15 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.34 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  47.91 
 
 		 220 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 225 aa  188  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  46.58 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.11 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 242 aa  187  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  47.91 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.12 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.61 
 
 		 261 aa  187  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  48.57 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.77 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  45.93 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  48.85 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  49.53 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  45.98 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.37 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  45.7 
 
 		 230 aa  184  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  46.51 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>