More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4258 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.29 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.64 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 220 aa  187  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  185  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  48.6 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  48.34 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.33 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.72 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.27 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  46.41 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  47.42 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  45.62 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.01 
 
 		 217 aa  177  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  47.03 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.87 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  45.05 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  50.24 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 222 aa  174  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 219 aa  174  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  45.28 
 
 		 221 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.23 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  46.23 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.79 
 
 		 239 aa  174  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.75 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.95 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  44.65 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  44.7 
 
 		 215 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 234 aa  171  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 238 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  43.11 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.55 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 303 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  42.86 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  47.2 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 		 249 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5556  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.53 
 
 		 255 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.05 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>