More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2171 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 216 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 223 aa  194  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  47.42 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  44.81 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  46.92 
 
 		 218 aa  188  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.6 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  45.75 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.13 
 
 		 216 aa  185  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  47.03 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  45.75 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  45.75 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  45.75 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  45.75 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 234 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  45.75 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  45.75 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 226 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.36 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.11 
 
 		 234 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 		 241 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.75 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  46.73 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  45.45 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.3 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  43.46 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 216 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.13 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.08 
 
 		 209 aa  177  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.7 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  42.99 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.55 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  40 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.6 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  43.33 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  43.33 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  45.07 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>