More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0116 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.46 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 212 aa  201  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.83 
 
 		 212 aa  187  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  45.85 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  48.29 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 222 aa  181  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  40.85 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.27 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.16 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.35 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  41.59 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.53 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.63 
 
 		 234 aa  173  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 234 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 234 aa  171  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  40.09 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  39.63 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  41.67 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  45.15 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  42.4 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.99 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 250 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 302 aa  168  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.15 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  44.23 
 
 		 218 aa  168  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 225 aa  167  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.15 
 
 		 211 aa  167  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  42.18 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6094  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.3 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634688  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>