More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1142 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  434  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  93.64 
 
 		 223 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.21 
 
 		 216 aa  285  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.59 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  51.1 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 218 aa  217  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  51.58 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.64 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.63 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.13 
 
 		 213 aa  211  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.34 
 
 		 222 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.77 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.02 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.68 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.67 
 
 		 226 aa  202  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  48.6 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  50.45 
 
 		 218 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.22 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.87 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  50.91 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  50 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  51.83 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 227 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 216 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 219 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.1 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  48.64 
 
 		 220 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.22 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.98 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.95 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.11 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.89 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  46.48 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  46.01 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.86 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.35 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.88 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.71 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 219 aa  194  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  46.01 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  46.48 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  46.48 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  46.48 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  46.79 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  46.48 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  46.48 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.79 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  46.82 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  47.56 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  45.66 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.22 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.35 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.35 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  46.01 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  48.37 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  45.66 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.11 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.08 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.64 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  48.02 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 214 aa  188  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.08 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  46.85 
 
 		 216 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.56 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>