More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0110 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  75.45 
 
 		 225 aa  337  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  74.21 
 
 		 221 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.18 
 
 		 224 aa  300  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.09 
 
 		 222 aa  288  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.16 
 
 		 221 aa  285  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  64.09 
 
 		 215 aa  279  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.26 
 
 		 224 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  67.42 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  65.9 
 
 		 219 aa  274  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.02 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.13 
 
 		 221 aa  265  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.21 
 
 		 244 aa  255  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.17 
 
 		 233 aa  254  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.54 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.83 
 
 		 218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  61.09 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.06 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.11 
 
 		 232 aa  251  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  59.56 
 
 		 226 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.26 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.36 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 223 aa  248  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  61.29 
 
 		 217 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.73 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.11 
 
 		 226 aa  245  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  60.37 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 223 aa  245  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.9 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  57.59 
 
 		 227 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.99 
 
 		 218 aa  244  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.5 
 
 		 221 aa  244  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  60.99 
 
 		 230 aa  244  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  62.84 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  57.34 
 
 		 261 aa  242  3e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  62.21 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.41 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.17 
 
 		 222 aa  241  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.9 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.72 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0303  two component LuxR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  57.92 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.33 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.99 
 
 		 215 aa  235  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.91 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.11 
 
 		 241 aa  234  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  58.3 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.99 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.4 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.34 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.86 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.11 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.04 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.01 
 
 		 224 aa  231  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  54.95 
 
 		 221 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  56.94 
 
 		 218 aa  231  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.7 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.11 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.05 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.45 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.26 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.76 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 226 aa  228  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.96 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  60.37 
 
 		 218 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.25 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.82 
 
 		 221 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.39 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.99 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.13 
 
 		 232 aa  225  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.5 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.16 
 
 		 218 aa  225  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  53.92 
 
 		 220 aa  224  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.34 
 
 		 241 aa  224  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.8 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.3 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.68 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.82 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.39 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  52.89 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.28 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.11 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.01 
 
 		 215 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  51.34 
 
 		 223 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 219 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.63 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  44.27 
 
 		 261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.91 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  54.79 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.89 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.5 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.5 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>