More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2491 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.16 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  70.91 
 
 		 303 aa  309  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  68.16 
 
 		 237 aa  305  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  67.71 
 
 		 237 aa  304  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.06 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  66.06 
 
 		 234 aa  288  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  66.06 
 
 		 234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  64.65 
 
 		 213 aa  275  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  62.83 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.19 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 238 aa  262  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.18 
 
 		 225 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.89 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 228 aa  192  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.36 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 216 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.09 
 
 		 218 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.38 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.01 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  46.95 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.04 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5643  two component LuxR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.54 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 213 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  46.05 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  41.47 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.79 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  45.58 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  42.33 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  45.71 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  41.1 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 216 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  42.33 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.81 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  41.98 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  40.27 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  42.44 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  44.08 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>