More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6192 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  59.39 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3764  two component LuxR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.28 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  50.68 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  52.49 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.61 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.97 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.97 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  49.32 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  47.96 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  46.61 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  46.61 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  46.61 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  46.61 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  46.61 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  46.61 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  46.61 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.66 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.01 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  42.79 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 		 253 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  41.82 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  41.1 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 212 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  41.94 
 
 		 213 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  39.73 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  41.2 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.45 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 215 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.36 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 228 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  38.12 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  36.99 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  36.99 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  36.99 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  39.56 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  38.21 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  38.21 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.705317  normal  0.304873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 		 213 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.91 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  36.96 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.27 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>