More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1438 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  69.16 
 
 		 237 aa  300  9e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.7 
 
 		 253 aa  300  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  67.76 
 
 		 237 aa  297  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  70.56 
 
 		 303 aa  296  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  68.84 
 
 		 234 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  67.44 
 
 		 234 aa  287  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  64.65 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.5 
 
 		 236 aa  256  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.47 
 
 		 225 aa  250  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.19 
 
 		 241 aa  237  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.43 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.46 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  45.97 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.55 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.6 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.79 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  43.2 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5643  two component LuxR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 203 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.92 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  45.5 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  45.63 
 
 		 218 aa  168  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 243 aa  167  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  42.44 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  42.38 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  42.65 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.66 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.66 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  41.52 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  42.72 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  44.34 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  41.63 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  45.63 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.66 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  41.63 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 1648 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>