More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4344 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 206 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.37 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  44.88 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  43 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  40.28 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 209 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 1648 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  41.04 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 303 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  41.5 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  38.92 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 240 aa  141  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  37.69 
 
 		 233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  38.81 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1558  response regulator receiver  36.63 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  38.92 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  38.92 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.31 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  38.42 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.62 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 227 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  37.16 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  37.16 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  37.16 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  37.16 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  37.16 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  37.16 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  37.16 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  40.39 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  36.7 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3764  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  36.95 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.68 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  37.81 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  40.1 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  36.32 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 242 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>