More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0175 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.29 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.88 
 
 		 211 aa  257  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  62.74 
 
 		 217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.95 
 
 		 206 aa  241  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 212 aa  238  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.75 
 
 		 211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.1 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  61.43 
 
 		 207 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 209 aa  228  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 212 aa  224  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  56.19 
 
 		 207 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.57 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.24 
 
 		 212 aa  221  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  57.28 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.06 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.24 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.24 
 
 		 209 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  54.25 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  54.72 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.9 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  51.36 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.67 
 
 		 222 aa  191  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 207 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.62 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.24 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.93 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.55 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.64 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  46.12 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.82 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  46.92 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  47.2 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  46.73 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.95 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 303 aa  174  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 213 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.4 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  39.71 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  44.34 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  47.87 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44.25 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.22 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.85 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.44 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  43.06 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>