More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2443 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 211 aa  225  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.61 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 212 aa  194  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  41.31 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  41.31 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  41.78 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  41.78 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 210 aa  161  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  38.54 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  38.54 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.36 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  38.05 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.2 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  40 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  40.38 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  40.64 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.91 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.6 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 242 aa  147  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 234 aa  147  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>