More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0621 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  420  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.22 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  51 
 
 		 209 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 209 aa  195  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  48.53 
 
 		 207 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.03 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.09 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 212 aa  175  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  41.12 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.13 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 207 aa  168  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.19 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  43.14 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  42.65 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 253 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.31 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  42.16 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.38 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  42.16 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.46 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  157  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  44.13 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.45 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.63 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  38.16 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.41 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  42.92 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 223 aa  151  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.38 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>