More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5893 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 218 aa  420  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  56.07 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  53.95 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.88 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.99 
 
 		 230 aa  204  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.54 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.3 
 
 		 220 aa  204  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.44 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.07 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.14 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  48.85 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.6 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  51.42 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  53.18 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.91 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.86 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.27 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.95 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  47.91 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.71 
 
 		 226 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  44.6 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0395  two component LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1603  two component LuxR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 		 231 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  48.86 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  47.89 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.91 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  47.73 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.82 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  48.13 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.24 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  50.48 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.09 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.05 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.23 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  44.7 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.09 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.85 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.58 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  46.4 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.25 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  43.84 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  47.22 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.01 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.33 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0231149  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  46.08 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  46.05 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  48.6 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4995  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>