More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0601 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 215 aa  414  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32780  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  71.16 
 
 		 216 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.16 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.95 
 
 		 230 aa  204  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  54.63 
 
 		 215 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  53.81 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.98 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.8 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.05 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.24 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.34 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  49.53 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.05 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.66 
 
 		 222 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.95 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  50.46 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  51.63 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  52.09 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 224 aa  187  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2672  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.240505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  51.61 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  47.89 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.85 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  49.53 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.21 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  48.62 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  49.1 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  46.98 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  48.84 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 215 aa  177  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.36 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  50.7 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.27 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.29 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4995  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.87 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  38.25 
 
 		 261 aa  175  4e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.7 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  44.65 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  48.83 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.66 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  45.62 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.93 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.91 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.24 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1986  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  48.62 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.87 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44.3 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.02 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  45.74 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.3 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  45.07 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  45.62 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.79 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.75 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.04 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.71 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>